PHP ApproximatePatternMatchingの例

コード例 #1

ファイル: ApproximatePatternMatchingProblem.php プロジェクト: nekhbet/bioinformatics

<?php

require __DIR__ . '/../../_common.php';
echo implode(' ', ApproximatePatternMatching('AAAAA', 'AACAAGCTGATAAACATTTAAAGAG', 1));

コード例 #2

ファイル: _common.php プロジェクト: nekhbet/bioinformatics

function ApproximatePatternCount($genome, $pattern, $max_hamming_distance)
{
    return count(ApproximatePatternMatching($pattern, $genome, $max_hamming_distance));
}